MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015695	AAG	2	6	16	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015695	AAG	2	6	51	56	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015695	ATG	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015695	CA	3	6	119	124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015695	TAAC	2	8	1354	1361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015695	CTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015695	TTA	2	6	4270	4275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015695	CGGC	2	8	5249	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015695	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015695	T	6	6	5261	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015695	A	7	7	5295	5301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015695	ATA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015695	ATT	2	6	5878	5883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015695	T	7	7	5892	5898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015695	ATTT	2	8	5948	5955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015695	AAT	2	6	5975	5980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015695	GCCCT	2	10	6888	6897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015695	TAATA	2	10	6902	6911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015695	AGGGC	2	10	6914	6923	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015695	TAT	2	6	9659	9664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015695	GAAT	2	8	9665	9672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015695	TGAT	2	8	9694	9701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015695	TTG	2	6	13887	13892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015695	TTAA	2	8	15123	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015695	TGAAA	2	10	15156	15165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015695	T	6	6	15169	15174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015695	ATT	2	6	15183	15188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015695	TCT	2	6	15199	15204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015695	ATG	2	6	15220	15225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015695	A	6	6	16384	16389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015695	CTT	2	6	16417	16422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015695	CTAC	2	8	16507	16514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015695	GTT	2	6	17380	17385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015695	T	6	6	18765	18770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015695	T	6	6	18819	18824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015695	ATT	2	6	18829	18834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015695	TA	3	6	18867	18872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015695	AATA	2	8	18891	18898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015695	TA	3	6	19980	19985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015695	A	6	6	21118	21123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015695	A	6	6	21132	21137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015695	ATA	2	6	21188	21193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015695	CATA	2	8	22397	22404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015695	TGAA	2	8	24104	24111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015695	GTT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015695	AAT	2	6	26671	26676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015695	T	6	6	28696	28701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015695	CAAAA	2	10	28706	28715	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015695	CTT	2	6	28811	28816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015695	TTG	2	6	28842	28847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015695	CTC	2	6	28850	28855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015695	ATTT	2	8	28869	28876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015695	T	7	7	29019	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015695	TAAA	2	8	29080	29087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015695	A	7	7	29125	29131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015695	AATT	2	8	29143	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015695	ATC	2	6	29372	29377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015695	ATC	2	6	29387	29392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015695	ATT	2	6	29394	29399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015695	AATA	2	8	29401	29408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015695	AAATCA	2	12	29424	29435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015695	A	7	7	29465	29471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015695	TCAA	2	8	29490	29497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015695	A	8	8	29496	29503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015695	A	6	6	29506	29511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015695	A	7	7	29531	29537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015695	A	6	6	29557	29562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015695	TTC	2	6	29624	29629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015695	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015695	T	6	6	29694	29699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015695	TAT	3	9	29719	29727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015695	A	10	10	29731	29740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015695	AAT	2	6	31709	31714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015695	TTCA	2	8	31805	31812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015695	AAGA	2	8	33675	33682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015695	GA	3	6	33727	33732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015695	TGAA	2	8	33746	33753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015695	AAT	2	6	34976	34981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015695	ACA	2	6	35022	35027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015695	ATTA	2	8	36582	36589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015695	ATT	2	6	36605	36610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015695	GTTA	2	8	38151	38158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015695	CATT	2	8	38214	38221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015695	AC	3	6	38289	38294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015695	ATG	2	6	38342	38347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015695	TAA	2	6	38404	38409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015695	A	6	6	38439	38444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015695	T	6	6	38469	38474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015695	T	6	6	38485	38490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015695	G	9	9	38492	38500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015695	A	8	8	38519	38526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015695	CA	3	6	38529	38534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015695	TATC	2	8	38545	38552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015695	TAGA	2	8	38579	38586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015695	ATA	2	6	38590	38595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015695	GAAA	2	8	38631	38638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015695	ATGA	2	8	38641	38648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015695	TTCA	2	8	38654	38661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015695	TGTGC	2	10	38675	38684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015695	GAT	2	6	38699	38704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015695	A	6	6	38737	38742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015695	AAT	2	6	38767	38772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.